MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p06

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018512	A	6	6	11	16	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018512	T	6	6	48	53	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018512	CATT	2	8	162	169	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018512	AAAT	2	8	176	183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018512	AGATA	2	10	194	203	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018512	A	7	7	208	214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018512	CAA	2	6	243	248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018512	T	6	6	264	269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018512	ATT	2	6	285	290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018512	TA	3	6	318	323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018512	ATA	2	6	325	330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018512	GAG	2	6	372	377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018512	T	7	7	1021	1027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018512	GT	3	6	1038	1043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018512	AC	3	6	1078	1083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018512	CAT	2	6	1090	1095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018512	CT	4	8	1136	1143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018512	TA	4	8	1152	1159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018512	GTA	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018512	T	6	6	1254	1259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018512	GTT	2	6	1310	1315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018512	TTC	2	6	1353	1358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018512	TTC	2	6	1486	1491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018512	CAA	2	6	1506	1511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018512	TATAT	2	10	1516	1525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018512	T	7	7	1621	1627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018512	AAT	2	6	1685	1690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018512	CAA	2	6	1705	1710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018512	CTT	2	6	1739	1744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018512	TAT	2	6	1878	1883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018512	T	7	7	1894	1900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018512	TGTA	2	8	1911	1918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018512	TTC	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018512	T	7	7	1931	1937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018512	TA	3	6	1963	1968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018512	T	6	6	2011	2016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018512	T	7	7	2019	2025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018512	A	6	6	2062	2067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018512	TTCAT	2	10	2097	2106	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018512	GTAT	2	8	2118	2125	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018512	AATT	2	8	2132	2139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018512	AATT	2	8	2142	2149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018512	A	7	7	2152	2158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018512	A	7	7	3469	3475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018512	T	7	7	3496	3502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018512	TAA	2	6	3512	3517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018512	ATT	2	6	3530	3535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018512	ACA	3	9	3550	3558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018512	TATG	2	8	3568	3575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018512	CGC	2	6	3618	3623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018512	AATA	2	8	3833	3840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018512	T	6	6	3986	3991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018512	AC	3	6	4052	4057	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018512	ATT	2	6	4092	4097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018512	AACAT	2	10	4119	4128	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018512	GTC	2	6	4167	4172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018512	AAC	2	6	4251	4256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018512	GAA	2	6	4277	4282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018512	TCA	2	6	4401	4406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018512	TGG	2	6	4477	4482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018512	ATT	2	6	6061	6066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018512	ACTA	2	8	6071	6078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018512	TG	3	6	6115	6120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018512	T	6	6	6133	6138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018512	ATTG	2	8	6209	6216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018512	A	7	7	6225	6231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018512	T	7	7	6256	6262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018512	TAC	2	6	6318	6323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018512	A	6	6	6341	6346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018512	TAA	2	6	6408	6413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018512	GTG	2	6	6414	6419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018512	TGT	2	6	6458	6463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018512	T	8	8	6494	6501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018512	GTC	2	6	6634	6639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018512	TGG	2	6	6640	6645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018512	A	8	8	6714	6721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018512	AAT	2	6	6735	6740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018512	T	8	8	6758	6765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018512	AAAT	2	8	6794	6801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018512	TAG	2	6	6818	6823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.